Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DKK2Q9UBU2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DKK2Q9UBU2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DKK2Q9UBU2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DKK2Q9UBU2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms