Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKLFQ9UBR5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKLFQ9UBR5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKLFQ9UBR5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKLFQ9UBR5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms