Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
REREQ9P2R6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
REREQ9P2R6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
REREQ9P2R6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
REREQ9P2R6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
REREQ9P2R6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
REREQ9P2R6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
REREQ9P2R6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
REREQ9P2R6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
REREQ9P2R6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
REREQ9P2R6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
REREQ9P2R6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
REREQ9P2R6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
REREQ9P2R6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
REREQ9P2R6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
REREQ9P2R6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
REREQ9P2R6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
REREQ9P2R6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
REREQ9P2R6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
REREQ9P2R6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
REREQ9P2R6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
REREQ9P2R6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
REREQ9P2R6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
REREQ9P2R6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
REREQ9P2R6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
REREQ9P2R6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
REREQ9P2R6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
REREQ9P2R6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
REREQ9P2R6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
REREQ9P2R6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
REREQ9P2R6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
REREQ9P2R6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
REREQ9P2R6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
REREQ9P2R6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
REREQ9P2R6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
REREQ9P2R6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
REREQ9P2R6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
REREQ9P2R6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
REREQ9P2R6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
REREQ9P2R6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
REREQ9P2R6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
REREQ9P2R6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
REREQ9P2R6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
REREQ9P2R6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
REREQ9P2R6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
REREQ9P2R6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
REREQ9P2R6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
REREQ9P2R6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
REREQ9P2R6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
REREQ9P2R6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
REREQ9P2R6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
REREQ9P2R6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
REREQ9P2R6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
REREQ9P2R6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
REREQ9P2R6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
REREQ9P2R6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
REREQ9P2R6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
REREQ9P2R6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
REREQ9P2R6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
REREQ9P2R6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
REREQ9P2R6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
REREQ9P2R6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
REREQ9P2R6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
REREQ9P2R6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
REREQ9P2R6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
REREQ9P2R6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
REREQ9P2R6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
REREQ9P2R6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
REREQ9P2R6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
REREQ9P2R6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
REREQ9P2R6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
REREQ9P2R6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
REREQ9P2R6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
REREQ9P2R6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
REREQ9P2R6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
REREQ9P2R6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
REREQ9P2R6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
REREQ9P2R6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
REREQ9P2R6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
REREQ9P2R6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms