Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTEL1Q9NZ71 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTEL1Q9NZ71 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTEL1Q9NZ71 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RTEL1Q9NZ71 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTEL1Q9NZ71 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTEL1Q9NZ71 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTEL1Q9NZ71 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTEL1Q9NZ71 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTEL1Q9NZ71 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1Q9NZ71 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1Q9NZ71 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1Q9NZ71 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTEL1Q9NZ71 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1Q9NZ71 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1Q9NZ71 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1Q9NZ71 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTEL1Q9NZ71 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTEL1Q9NZ71 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTEL1Q9NZ71 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTEL1Q9NZ71 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTEL1Q9NZ71 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RTEL1Q9NZ71 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTEL1Q9NZ71 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTEL1Q9NZ71 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTEL1Q9NZ71 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RTEL1Q9NZ71 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RTEL1Q9NZ71 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RTEL1Q9NZ71 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RTEL1Q9NZ71 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RTEL1Q9NZ71 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RTEL1Q9NZ71 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RTEL1Q9NZ71 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RTEL1Q9NZ71 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RTEL1Q9NZ71 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RTEL1Q9NZ71 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTEL1Q9NZ71 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTEL1Q9NZ71 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RTEL1Q9NZ71 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RTEL1Q9NZ71 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1Q9NZ71 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1Q9NZ71 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms