Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL39Q9NYK5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL39Q9NYK5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL39Q9NYK5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL39Q9NYK5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms