Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.126e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.166e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 PRMT5-218ENST00000555454 771 ntTSL 57.79□□□□□ -1.166e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 PRMT5-207ENST00000476175 682 ntTSL 27.1□□□□□ -1.276e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 PRMT5-206ENST00000454731 617 ntTSL 36.62□□□□□ -1.356e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 USP34-207ENST00000463046 6307 ntTSL 26.26□□□□□ -1.416e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 ZNF223-203ENST00000588518 558 ntTSL 55.98□□□□□ -1.456e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 PRMT5-226ENST00000557443 337 ntTSL 35.58□□□□□ -1.526e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 USP34-211ENST00000472706 556 ntTSL 44.74□□□□□ -1.656e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 PRMT5-227ENST00000557758 597 ntTSL 34.44□□□□□ -1.76e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 PCNX1-205ENST00000553508 645 ntTSL 33.68□□□□□ -1.826e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 HSPD1-213ENST00000486181 648 ntTSL 23.13□□□□□ -1.916e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 USP34-205ENST00000453734 2708 ntTSL 1 (best)1.62□□□□□ -2.156e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.852e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.852e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.482e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.42e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.942e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.642e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 RPS17-210ENST00000561440 1922 ntTSL 217.1■□□□□ 0.332e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.272e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.232e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 TOMM40-206ENST00000592041 707 ntTSL 215.93■□□□□ 0.142e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 RPS17-205ENST00000560229 776 ntTSL 1 (best)13.48□□□□□ -0.252e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 FBXO11-209ENST00000492225 2216 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.42e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 CAPZA1-201ENST00000263168 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.722e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 CAPZA1-205ENST00000485542 739 ntTSL 29.56□□□□□ -0.882e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 EIF4A1-227ENST00000583217 599 ntTSL 29.02□□□□□ -0.972e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.042e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.092e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 RPS17-206ENST00000560612 1877 ntTSL 27.98□□□□□ -1.132e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 CAPZA1-206ENST00000498626 650 ntTSL 57.73□□□□□ -1.172e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.272e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 EIF4A1-210ENST00000578569 583 ntTSL 26.67□□□□□ -1.342e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 CAPZA1-204ENST00000476936 867 ntTSL 35.33□□□□□ -1.562e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 RPS17-208ENST00000561068 522 ntTSL 34.77□□□□□ -1.652e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 RPS17-202ENST00000558397 583 ntTSL 34.69□□□□□ -1.662e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 RPS17-207ENST00000560639 932 ntTSL 54.68□□□□□ -1.662e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 FBXO11-210ENST00000493962 1986 ntTSL 22.98□□□□□ -1.932e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.032e-11■■■■■ 47.4
RBM22Q9NW64 UBE2O-206ENST00000590658 567 ntTSL 411.7□□□□□ -0.543e-9■■■■■ 47.2
RBM22Q9NW64 LARS-210ENST00000508667 707 ntTSL 37.99□□□□□ -1.136e-7■■■■■ 47.1
RBM22Q9NW64 LARS-209ENST00000507095 384 ntTSL 35.89□□□□□ -1.476e-7■■■■■ 47.1
RBM22Q9NW64 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 47
RBM22Q9NW64 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.162e-10■■■■■ 47
RBM22Q9NW64 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.122e-10■■■■■ 47
RBM22Q9NW64 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.912e-10■■■■■ 47
RBM22Q9NW64 UCHL5-203ENST00000367450 1355 ntTSL 519.41■□□□□ 0.72e-10■■■■■ 47
RBM22Q9NW64 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.692e-10■■■■■ 47
RBM22Q9NW64 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.282e-10■■■■■ 47
RBM22Q9NW64 UCHL5-210ENST00000421683 834 ntTSL 310.44□□□□□ -0.742e-10■■■■■ 47
RBM22Q9NW64 UCHL5-209ENST00000420791 1329 ntTSL 52.12□□□□□ -2.072e-10■■■■■ 47
RBM22Q9NW64 UCHL5-211ENST00000443327 785 ntTSL 51.79□□□□□ -2.122e-10■■■■■ 47
RBM22Q9NW64 ALYREF-203ENST00000511412 533 ntTSL 324.59■■□□□ 1.531e-8■■■■■ 46.7
RBM22Q9NW64 GPCPD1-206ENST00000481690 819 ntTSL 322.2■■□□□ 1.148e-19■■■■■ 46.7
RBM22Q9NW64 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.054e-7■■■■■ 46.6
RBM22Q9NW64 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.164e-7■■■■■ 46.6
RBM22Q9NW64 IK-211ENST00000610522 737 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.773e-9■■■■■ 46.5
RBM22Q9NW64 IK-201ENST00000417647 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.773e-9■■■■■ 46.5
RBM22Q9NW64 IK-208ENST00000515015 493 ntTSL 27.89□□□□□ -1.153e-9■■■■■ 46.5
RBM22Q9NW64 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.14e-8■■■■■ 46.3
RBM22Q9NW64 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.114e-8■■■■■ 46.3
RBM22Q9NW64 CARS2-230ENST00000543487 870 ntTSL 519.55■□□□□ 0.722e-9■■■■■ 46.2
RBM22Q9NW64 CARS2-216ENST00000537743 466 ntTSL 54.42□□□□□ -1.72e-9■■■■■ 46.2
RBM22Q9NW64 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 46.2
RBM22Q9NW64 ZNF337-203ENST00000481610 572 ntTSL 36.98□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 46.2
RBM22Q9NW64 CALM2-207ENST00000484408 682 ntTSL 521.1■□□□□ 0.973e-19■■■■■ 45.9
RBM22Q9NW64 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.663e-19■■■■■ 45.9
RBM22Q9NW64 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.523e-19■■■■■ 45.9
RBM22Q9NW64 CALM2-208ENST00000489742 522 ntTSL 316.09■□□□□ 0.173e-19■■■■■ 45.9
RBM22Q9NW64 CALM2-203ENST00000432899 1004 ntTSL 513.33□□□□□ -0.283e-19■■■■■ 45.9
RBM22Q9NW64 STPG4-206ENST00000422269 983 ntTSL 211.3□□□□□ -0.63e-19■■■■■ 45.9
RBM22Q9NW64 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.883e-19■■■■■ 45.9
RBM22Q9NW64 CALM2-204ENST00000456319 703 ntTSL 22.39□□□□□ -2.033e-19■■■■■ 45.9
RBM22Q9NW64 DDX39B-203ENST00000417023 561 ntTSL 513.01□□□□□ -0.339e-7■■■■■ 45.9
RBM22Q9NW64 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.739e-7■■■■■ 45.9
RBM22Q9NW64 DDX39B-221ENST00000484566 857 ntTSL 58.27□□□□□ -1.099e-7■■■■■ 45.9
RBM22Q9NW64 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.063e-16■■■■■ 45.9
RBM22Q9NW64 USP37-204ENST00000418019 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.123e-16■■■■■ 45.9
RBM22Q9NW64 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.233e-16■■■■■ 45.9
RBM22Q9NW64 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.33e-16■■■■■ 45.9
RBM22Q9NW64 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.383e-16■■■■■ 45.9
RBM22Q9NW64 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.785e-15■■■■■ 45.8
RBM22Q9NW64 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.725e-15■■■■■ 45.8
RBM22Q9NW64 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.465e-15■■■■■ 45.8
RBM22Q9NW64 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.125e-15■■■■■ 45.8
RBM22Q9NW64 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 45.8
RBM22Q9NW64 DLST-210ENST00000555492 569 ntTSL 311.32□□□□□ -0.62e-9■■■■■ 45.8
RBM22Q9NW64 DLST-201ENST00000238671 1464 ntTSL 211.26□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 45.8
RBM22Q9NW64 DLST-202ENST00000334220 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.682e-9■■■■■ 45.8
RBM22Q9NW64 DLST-214ENST00000556582 568 ntTSL 39.83□□□□□ -0.842e-9■■■■■ 45.8
RBM22Q9NW64 DLST-204ENST00000554612 1479 ntTSL 29.69□□□□□ -0.862e-9■■■■■ 45.8
RBM22Q9NW64 DLST-209ENST00000555459 567 ntTSL 49.66□□□□□ -0.862e-9■■■■■ 45.8
RBM22Q9NW64 DLST-208ENST00000555190 803 ntTSL 49.66□□□□□ -0.862e-9■■■■■ 45.8
RBM22Q9NW64 DLST-206ENST00000555071 1365 ntTSL 29.57□□□□□ -0.882e-9■■■■■ 45.8
RBM22Q9NW64 DLST-205ENST00000554806 837 ntTSL 1 (best)8.6□□□□□ -1.032e-9■■■■■ 45.8
RBM22Q9NW64 DLST-207ENST00000555089 1078 ntTSL 1 (best)8.53□□□□□ -1.042e-9■■■■■ 45.8
RBM22Q9NW64 DLST-213ENST00000556460 563 ntTSL 38.47□□□□□ -1.052e-9■■■■■ 45.8
RBM22Q9NW64 DLST-211ENST00000555988 718 ntTSL 58.4□□□□□ -1.062e-9■■■■■ 45.8
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