RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP25-201ENST00000285679 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.81■■□□□ 1.24
USP25-201ENST00000285679 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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USP25-201ENST00000285679 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.54■■□□□ 1.2
USP25-201ENST00000285679 ITGAEP38570 1179 aa22.53■■□□□ 1.2
USP25-201ENST00000285679 BCANQ96GW7 911 aa22.52■■□□□ 1.2
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USP25-201ENST00000285679 FKBP8Q14318 412 aa21.97■■□□□ 1.11
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USP25-201ENST00000285679 TRIM52Q96A61 297 aa21.84■■□□□ 1.09
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USP25-201ENST00000285679 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
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USP25-201ENST00000285679 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.75■■□□□ 1.07
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USP25-201ENST00000285679 NCAPD3P42695 1498 aa21.7■■□□□ 1.07
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USP25-201ENST00000285679 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
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USP25-201ENST00000285679 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
USP25-201ENST00000285679 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.46■■□□□ 1.03
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USP25-201ENST00000285679 SYNJ1O43426 1573 aa21.43■■□□□ 1.02
USP25-201ENST00000285679 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
USP25-201ENST00000285679 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.39■■□□□ 1.01
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