Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCM2LQ9NUG4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCM2LQ9NUG4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCM2LQ9NUG4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCM2LQ9NUG4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms