Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI6

BRWD1, Bromodomain and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD1Q9NSI6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRWD1Q9NSI6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRWD1Q9NSI6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRWD1Q9NSI6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRWD1Q9NSI6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRWD1Q9NSI6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRWD1Q9NSI6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRWD1Q9NSI6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRWD1Q9NSI6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRWD1Q9NSI6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRWD1Q9NSI6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRWD1Q9NSI6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRWD1Q9NSI6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRWD1Q9NSI6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRWD1Q9NSI6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRWD1Q9NSI6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRWD1Q9NSI6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRWD1Q9NSI6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRWD1Q9NSI6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRWD1Q9NSI6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRWD1Q9NSI6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRWD1Q9NSI6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRWD1Q9NSI6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRWD1Q9NSI6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRWD1Q9NSI6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRWD1Q9NSI6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRWD1Q9NSI6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRWD1Q9NSI6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRWD1Q9NSI6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRWD1Q9NSI6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRWD1Q9NSI6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRWD1Q9NSI6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRWD1Q9NSI6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRWD1Q9NSI6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRWD1Q9NSI6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRWD1Q9NSI6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms