Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPRMQ9NS64 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPRMQ9NS64 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRMQ9NS64 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPRMQ9NS64 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms