Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD2Q9NRG4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD2Q9NRG4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD2Q9NRG4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD2Q9NRG4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD2Q9NRG4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD2Q9NRG4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMYD2Q9NRG4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMYD2Q9NRG4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMYD2Q9NRG4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMYD2Q9NRG4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMYD2Q9NRG4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMYD2Q9NRG4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMYD2Q9NRG4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMYD2Q9NRG4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMYD2Q9NRG4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMYD2Q9NRG4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMYD2Q9NRG4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMYD2Q9NRG4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMYD2Q9NRG4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMYD2Q9NRG4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMYD2Q9NRG4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms