Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BATF3Q9NR55 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BATF3Q9NR55 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BATF3Q9NR55 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BATF3Q9NR55 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BATF3Q9NR55 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms