Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf4Q9NR00 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf4Q9NR00 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C8orf4Q9NR00 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C8orf4Q9NR00 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8orf4Q9NR00 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf4Q9NR00 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms