Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD93Q9NPY3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD93Q9NPY3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD93Q9NPY3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD93Q9NPY3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD93Q9NPY3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD93Q9NPY3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD93Q9NPY3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD93Q9NPY3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD93Q9NPY3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD93Q9NPY3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD93Q9NPY3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD93Q9NPY3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD93Q9NPY3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD93Q9NPY3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CD93Q9NPY3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD93Q9NPY3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD93Q9NPY3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD93Q9NPY3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD93Q9NPY3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD93Q9NPY3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CD93Q9NPY3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD93Q9NPY3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD93Q9NPY3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD93Q9NPY3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CD93Q9NPY3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD93Q9NPY3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD93Q9NPY3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD93Q9NPY3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD93Q9NPY3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD93Q9NPY3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD93Q9NPY3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CD93Q9NPY3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD93Q9NPY3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms