Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APOBEC3GQ9HC16 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
APOBEC3GQ9HC16 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3GQ9HC16 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3GQ9HC16 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3GQ9HC16 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3GQ9HC16 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOBEC3GQ9HC16 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOBEC3GQ9HC16 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBEC3GQ9HC16 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBEC3GQ9HC16 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBEC3GQ9HC16 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
APOBEC3GQ9HC16 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOBEC3GQ9HC16 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms