Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAE3

EFCAB1, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB1Q9HAE3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFCAB1Q9HAE3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFCAB1Q9HAE3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFCAB1Q9HAE3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFCAB1Q9HAE3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFCAB1Q9HAE3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFCAB1Q9HAE3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB1Q9HAE3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB1Q9HAE3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB1Q9HAE3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB1Q9HAE3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFCAB1Q9HAE3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFCAB1Q9HAE3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFCAB1Q9HAE3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFCAB1Q9HAE3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB1Q9HAE3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFCAB1Q9HAE3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFCAB1Q9HAE3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFCAB1Q9HAE3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms