Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SENP3Q9H4L4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SENP3Q9H4L4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SENP3Q9H4L4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SENP3Q9H4L4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SENP3Q9H4L4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SENP3Q9H4L4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SENP3Q9H4L4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SENP3Q9H4L4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
SENP3Q9H4L4 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
SENP3Q9H4L4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SENP3Q9H4L4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SENP3Q9H4L4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SENP3Q9H4L4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SENP3Q9H4L4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SENP3Q9H4L4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SENP3Q9H4L4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SENP3Q9H4L4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SENP3Q9H4L4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SENP3Q9H4L4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SENP3Q9H4L4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SENP3Q9H4L4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SENP3Q9H4L4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SENP3Q9H4L4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SENP3Q9H4L4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SENP3Q9H4L4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SENP3Q9H4L4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SENP3Q9H4L4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SENP3Q9H4L4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
SENP3Q9H4L4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SENP3Q9H4L4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SENP3Q9H4L4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SENP3Q9H4L4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SENP3Q9H4L4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SENP3Q9H4L4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SENP3Q9H4L4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
SENP3Q9H4L4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SENP3Q9H4L4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SENP3Q9H4L4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SENP3Q9H4L4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SENP3Q9H4L4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SENP3Q9H4L4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SENP3Q9H4L4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SENP3Q9H4L4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SENP3Q9H4L4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SENP3Q9H4L4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SENP3Q9H4L4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SENP3Q9H4L4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SENP3Q9H4L4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SENP3Q9H4L4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SENP3Q9H4L4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SENP3Q9H4L4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
SENP3Q9H4L4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37■■■■□ 3.51
SENP3Q9H4L4 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SENP3Q9H4L4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
SENP3Q9H4L4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SENP3Q9H4L4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SENP3Q9H4L4 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SENP3Q9H4L4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SENP3Q9H4L4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SENP3Q9H4L4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SENP3Q9H4L4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SENP3Q9H4L4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms