Protein–RNA interactions for Protein: Q9H426

RIMS4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS4Q9H426 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIMS4Q9H426 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIMS4Q9H426 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RIMS4Q9H426 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIMS4Q9H426 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIMS4Q9H426 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIMS4Q9H426 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIMS4Q9H426 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIMS4Q9H426 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS4Q9H426 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS4Q9H426 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS4Q9H426 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIMS4Q9H426 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms