Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIPK3Q9H422 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIPK3Q9H422 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HIPK3Q9H422 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIPK3Q9H422 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIPK3Q9H422 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIPK3Q9H422 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIPK3Q9H422 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIPK3Q9H422 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HIPK3Q9H422 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HIPK3Q9H422 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIPK3Q9H422 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HIPK3Q9H422 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIPK3Q9H422 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIPK3Q9H422 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIPK3Q9H422 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HIPK3Q9H422 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIPK3Q9H422 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIPK3Q9H422 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIPK3Q9H422 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIPK3Q9H422 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIPK3Q9H422 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIPK3Q9H422 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIPK3Q9H422 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIPK3Q9H422 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIPK3Q9H422 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HIPK3Q9H422 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms