Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCXQ9H320 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCXQ9H320 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VCXQ9H320 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCXQ9H320 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms