Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6AQ9H2E6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6AQ9H2E6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6AQ9H2E6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6AQ9H2E6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6AQ9H2E6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6AQ9H2E6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6AQ9H2E6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6AQ9H2E6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6AQ9H2E6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6AQ9H2E6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6AQ9H2E6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6AQ9H2E6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6AQ9H2E6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA6AQ9H2E6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA6AQ9H2E6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA6AQ9H2E6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA6AQ9H2E6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms