Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED28Q9H204 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED28Q9H204 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED28Q9H204 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms