Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SMG9Q9H0W8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMG9Q9H0W8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMG9Q9H0W8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMG9Q9H0W8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMG9Q9H0W8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMG9Q9H0W8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMG9Q9H0W8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMG9Q9H0W8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMG9Q9H0W8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMG9Q9H0W8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMG9Q9H0W8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SMG9Q9H0W8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMG9Q9H0W8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
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