Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC2Q9C0B9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC2Q9C0B9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC2Q9C0B9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC2Q9C0B9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms