Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms