Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TUBB2BQ9BVA1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBB2BQ9BVA1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBB2BQ9BVA1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBB2BQ9BVA1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBB2BQ9BVA1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBB2BQ9BVA1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBB2BQ9BVA1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBB2BQ9BVA1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBB2BQ9BVA1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBB2BQ9BVA1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBB2BQ9BVA1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBB2BQ9BVA1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBB2BQ9BVA1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBB2BQ9BVA1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBB2BQ9BVA1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBB2BQ9BVA1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBB2BQ9BVA1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBB2BQ9BVA1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TUBB2BQ9BVA1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBB2BQ9BVA1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms