Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KATNB1Q9BVA0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KATNB1Q9BVA0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KATNB1Q9BVA0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KATNB1Q9BVA0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms