Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYT17Q9BSW7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYT17Q9BSW7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SYT17Q9BSW7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SYT17Q9BSW7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SYT17Q9BSW7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SYT17Q9BSW7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SYT17Q9BSW7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SYT17Q9BSW7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SYT17Q9BSW7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYT17Q9BSW7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYT17Q9BSW7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYT17Q9BSW7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYT17Q9BSW7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYT17Q9BSW7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYT17Q9BSW7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYT17Q9BSW7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYT17Q9BSW7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SYT17Q9BSW7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SYT17Q9BSW7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
SYT17Q9BSW7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
SYT17Q9BSW7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYT17Q9BSW7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SYT17Q9BSW7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYT17Q9BSW7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SYT17Q9BSW7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYT17Q9BSW7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYT17Q9BSW7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYT17Q9BSW7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SYT17Q9BSW7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SYT17Q9BSW7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SYT17Q9BSW7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SYT17Q9BSW7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SYT17Q9BSW7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYT17Q9BSW7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYT17Q9BSW7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYT17Q9BSW7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYT17Q9BSW7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SYT17Q9BSW7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SYT17Q9BSW7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SYT17Q9BSW7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SYT17Q9BSW7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYT17Q9BSW7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
SYT17Q9BSW7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYT17Q9BSW7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYT17Q9BSW7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYT17Q9BSW7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYT17Q9BSW7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYT17Q9BSW7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SYT17Q9BSW7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SYT17Q9BSW7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYT17Q9BSW7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYT17Q9BSW7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYT17Q9BSW7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYT17Q9BSW7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SYT17Q9BSW7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYT17Q9BSW7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYT17Q9BSW7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYT17Q9BSW7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYT17Q9BSW7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYT17Q9BSW7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYT17Q9BSW7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYT17Q9BSW7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SYT17Q9BSW7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYT17Q9BSW7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYT17Q9BSW7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYT17Q9BSW7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYT17Q9BSW7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SYT17Q9BSW7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYT17Q9BSW7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYT17Q9BSW7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYT17Q9BSW7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYT17Q9BSW7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYT17Q9BSW7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYT17Q9BSW7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms