Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM175Q9BSA9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM175Q9BSA9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM175Q9BSA9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM175Q9BSA9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms