Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PYM1Q9BRP8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PYM1Q9BRP8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PYM1Q9BRP8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PYM1Q9BRP8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PYM1Q9BRP8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PYM1Q9BRP8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PYM1Q9BRP8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PYM1Q9BRP8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PYM1Q9BRP8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PYM1Q9BRP8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms