Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOL4Q9BPW4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOL4Q9BPW4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOL4Q9BPW4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOL4Q9BPW4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL4Q9BPW4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms