Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIPEPQ99797 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIPEPQ99797 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIPEPQ99797 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIPEPQ99797 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MIPEPQ99797 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MIPEPQ99797 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIPEPQ99797 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIPEPQ99797 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIPEPQ99797 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIPEPQ99797 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIPEPQ99797 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIPEPQ99797 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIPEPQ99797 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms