Protein–RNA interactions for Protein: Q99788

CMKLR1, Chemokine-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMKLR1Q99788 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CMKLR1Q99788 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CMKLR1Q99788 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CMKLR1Q99788 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CMKLR1Q99788 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CMKLR1Q99788 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms