Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL7

VPS13A, Vacuolar protein sorting-associated protein 13A, humanhuman

Predictions only

Length 3,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13AQ96RL7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS13AQ96RL7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS13AQ96RL7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS13AQ96RL7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS13AQ96RL7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS13AQ96RL7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS13AQ96RL7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS13AQ96RL7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS13AQ96RL7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS13AQ96RL7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS13AQ96RL7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS13AQ96RL7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS13AQ96RL7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS13AQ96RL7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS13AQ96RL7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS13AQ96RL7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
VPS13AQ96RL7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS13AQ96RL7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS13AQ96RL7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS13AQ96RL7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS13AQ96RL7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS13AQ96RL7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS13AQ96RL7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS13AQ96RL7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS13AQ96RL7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms