Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC38A2Q96QD8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC38A2Q96QD8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A2Q96QD8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A2Q96QD8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms