Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC115Q96NT0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC115Q96NT0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC115Q96NT0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC115Q96NT0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC115Q96NT0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms