Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMEM87BQ96K49 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMEM87BQ96K49 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TMEM87BQ96K49 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMEM87BQ96K49 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMEM87BQ96K49 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMEM87BQ96K49 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMEM87BQ96K49 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMEM87BQ96K49 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMEM87BQ96K49 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMEM87BQ96K49 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMEM87BQ96K49 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMEM87BQ96K49 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMEM87BQ96K49 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMEM87BQ96K49 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMEM87BQ96K49 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMEM87BQ96K49 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMEM87BQ96K49 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMEM87BQ96K49 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMEM87BQ96K49 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TMEM87BQ96K49 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms