Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IMP4Q96G21 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IMP4Q96G21 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IMP4Q96G21 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IMP4Q96G21 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IMP4Q96G21 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IMP4Q96G21 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IMP4Q96G21 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IMP4Q96G21 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IMP4Q96G21 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IMP4Q96G21 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IMP4Q96G21 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms