Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00526Q96FQ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00526Q96FQ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00526Q96FQ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms