Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A6EQ96DS6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MS4A6EQ96DS6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A6EQ96DS6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A6EQ96DS6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A6EQ96DS6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A6EQ96DS6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A6EQ96DS6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A6EQ96DS6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A6EQ96DS6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A6EQ96DS6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A6EQ96DS6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A6EQ96DS6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A6EQ96DS6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A6EQ96DS6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A6EQ96DS6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A6EQ96DS6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A6EQ96DS6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A6EQ96DS6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A6EQ96DS6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A6EQ96DS6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A6EQ96DS6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A6EQ96DS6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A6EQ96DS6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A6EQ96DS6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A6EQ96DS6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A6EQ96DS6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A6EQ96DS6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A6EQ96DS6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A6EQ96DS6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms