Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC39Q96DD0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC39Q96DD0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC39Q96DD0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC39Q96DD0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms