Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP1MTQ969P6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TOP1MTQ969P6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP1MTQ969P6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP1MTQ969P6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP1MTQ969P6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TOP1MTQ969P6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TOP1MTQ969P6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP1MTQ969P6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP1MTQ969P6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP1MTQ969P6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP1MTQ969P6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP1MTQ969P6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP1MTQ969P6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP1MTQ969P6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP1MTQ969P6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP1MTQ969P6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP1MTQ969P6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP1MTQ969P6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP1MTQ969P6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP1MTQ969P6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms