Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LHX4Q969G2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LHX4Q969G2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LHX4Q969G2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX4Q969G2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LHX4Q969G2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX4Q969G2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LHX4Q969G2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX4Q969G2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX4Q969G2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX4Q969G2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LHX4Q969G2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LHX4Q969G2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LHX4Q969G2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX4Q969G2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX4Q969G2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LHX4Q969G2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX4Q969G2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHX4Q969G2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LHX4Q969G2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX4Q969G2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LHX4Q969G2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LHX4Q969G2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LHX4Q969G2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LHX4Q969G2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHX4Q969G2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LHX4Q969G2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHX4Q969G2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHX4Q969G2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms