Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NKD2Q969F2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NKD2Q969F2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NKD2Q969F2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKD2Q969F2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKD2Q969F2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKD2Q969F2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKD2Q969F2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKD2Q969F2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKD2Q969F2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKD2Q969F2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKD2Q969F2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKD2Q969F2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKD2Q969F2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NKD2Q969F2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NKD2Q969F2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NKD2Q969F2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NKD2Q969F2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NKD2Q969F2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.4 ms