Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A1Q93096 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A1Q93096 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTP4A1Q93096 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A1Q93096 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A1Q93096 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A1Q93096 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A1Q93096 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A1Q93096 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTP4A1Q93096 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTP4A1Q93096 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A1Q93096 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A1Q93096 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A1Q93096 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A1Q93096 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A1Q93096 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A1Q93096 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A1Q93096 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms