Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX33Q8WV41 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX33Q8WV41 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX33Q8WV41 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms