Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C17orf47Q8NEP4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C17orf47Q8NEP4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C17orf47Q8NEP4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C17orf47Q8NEP4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C17orf47Q8NEP4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms