Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC112Q8NEF3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC112Q8NEF3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC112Q8NEF3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC112Q8NEF3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC112Q8NEF3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC112Q8NEF3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC112Q8NEF3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC112Q8NEF3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC112Q8NEF3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC112Q8NEF3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC112Q8NEF3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC112Q8NEF3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC112Q8NEF3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC112Q8NEF3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC112Q8NEF3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC112Q8NEF3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC112Q8NEF3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC112Q8NEF3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms