Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE62

CHDH, Choline dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHDHQ8NE62 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHDHQ8NE62 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHDHQ8NE62 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHDHQ8NE62 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHDHQ8NE62 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHDHQ8NE62 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHDHQ8NE62 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHDHQ8NE62 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHDHQ8NE62 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHDHQ8NE62 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHDHQ8NE62 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHDHQ8NE62 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHDHQ8NE62 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHDHQ8NE62 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHDHQ8NE62 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHDHQ8NE62 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHDHQ8NE62 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHDHQ8NE62 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms