Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PNPLA1Q8N8W4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PNPLA1Q8N8W4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PNPLA1Q8N8W4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA1Q8N8W4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA1Q8N8W4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA1Q8N8W4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA1Q8N8W4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNPLA1Q8N8W4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNPLA1Q8N8W4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA1Q8N8W4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA1Q8N8W4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA1Q8N8W4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNPLA1Q8N8W4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNPLA1Q8N8W4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms